殺菌機工作生產一定時間就需要清洗，清洗間隔時間的長短及清洗是否徹底，都會直接影響產品質量，影響殺菌機的使用效率。殺菌機與其他設備如降膜式蒸發器不同，蒸發器生產清洗完畢可以將蒸發器的上下器蓋等直接打開，比較方便，而殺菌機管束較多，容易清洗不徹底，檢查會比較困難。近年來由于清洗不到位而影響產品質量的情況比較多見，本文以處理量為1000kg/h的管式殺菌機在膠原蛋白殺菌上的應用為例進行闡述。
物料介質：膠原蛋白濃縮液。
處理量：1000kg/h。
牛奶進入溫度：45℃。
牛奶進入干物質含量：45%。
使用蒸汽壓力：0.8MPa。
殺菌溫度：137℃。
結構特點：本殺菌機為管式殺菌機，生產工藝流程如圖1所示。本殺菌機分為殺菌段與冷卻段兩段，冷卻段采用塔水冷卻。本機的主要工作過程為：物料→加熱殺菌→保持→冷卻→出料。在殺菌機中一般只設置酸堿罐（多為PP材料方形桶），水洗可采用啟動的熱水罐替代，如本例所示。為了清洗徹底，一般清洗流速要高于物料流速。本例物料在管式殺菌機中流速按1m/h設計，水、酸、堿清洗時流速一般是物料流速的兩倍或兩倍以上的流速，即清洗液流速在2m/s～2.5m/s即可，這樣可達到流速快、清洗徹底、效果好的目的。
殺菌機在開機前一般只進行熱水清洗，清洗是指凡是與物料接觸部位即包括所有物料管道及殺菌冷卻回流管道等的清洗，熱水的溫度為50℃～60℃，本例清洗過程為：原熱水→進料管道→加熱段換熱管道→冷卻段換熱管道→原水缸→回流管道→物料罐。
清洗時間應根據殺菌機結垢結焦具體情況而定。設備清洗完畢需要將殺菌段換熱管端部定期打開觀察，如果經過清洗后仍有垢層附著在換熱管的管壁表面就應該借助清理工具將其清理掉，然后再進行清洗，這樣就能達到清洗徹底的目的。
清洗液在設備內流速的大小與清洗是否徹底有關。清洗流速要高于料液在換熱管（或板片之間）中的流速，一般是料液2倍以上的流速。清洗液的配比及清洗時間長短直接影響清洗效果，酸堿配比即Na OH與硝酸清洗液配比一般各占2%～3%，酸堿濃度應由在線酸堿濃度檢測儀完成。清洗程序的設定也非常重要，清洗時間的長短是由垢結焦程度決定的，清洗必須嚴格按照清洗程序及清洗時間才能獲得較好的清洗效果。
清洗是殺菌機工作過程中必須的步驟，設備使用一段時間根據殺菌溫度的穩定性情況決定是否需要清洗。清洗要徹底不能留死角，此外在清洗完成后還要將換熱管端部不定期的打開檢查。主要檢查殺菌段換熱管內清洗后，是否還有未清洗掉的殘留物，如果有就要及時清理掉，然后再進行清洗，只有這樣才能獲得良好工作狀態和殺菌效果。
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